Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms