Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
E9PCH4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
E9PCH4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
E9PCH4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
E9PCH4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
E9PCH4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
E9PCH4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
E9PCH4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
E9PCH4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
E9PCH4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
E9PCH4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
E9PCH4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
E9PCH4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
E9PCH4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
E9PCH4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
E9PCH4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
E9PCH4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
E9PCH4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
E9PCH4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
E9PCH4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
E9PCH4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
E9PCH4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
E9PCH4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
E9PCH4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
E9PCH4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
E9PCH4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
E9PCH4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
E9PCH4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
E9PCH4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
E9PCH4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
E9PCH4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
E9PCH4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
E9PCH4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
E9PCH4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
E9PCH4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
E9PCH4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
E9PCH4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
E9PCH4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
E9PCH4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
E9PCH4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
E9PCH4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
E9PCH4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
E9PCH4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
E9PCH4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
E9PCH4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
E9PCH4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
E9PCH4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
E9PCH4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
E9PCH4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
E9PCH4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
E9PCH4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
E9PCH4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
E9PCH4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
E9PCH4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
E9PCH4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
E9PCH4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
E9PCH4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
E9PCH4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
E9PCH4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
E9PCH4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
E9PCH4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
E9PCH4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
E9PCH4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
E9PCH4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
E9PCH4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
E9PCH4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
E9PCH4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
E9PCH4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
E9PCH4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
E9PCH4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
E9PCH4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
E9PCH4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
E9PCH4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
E9PCH4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
E9PCH4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
E9PCH4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
E9PCH4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
E9PCH4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms