Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRRM3A6NNA2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRRM3A6NNA2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms