Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC85CA6NKD9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms