Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms