Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PSDA5PKW4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSDA5PKW4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms