Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms