Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AP000879.2-201ENST00000530525 497 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 HHLA3-207ENST00000531950 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC010542.1-201ENST00000568430 555 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 KRTAP4-1-202ENST00000620667 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.108-201ENST00000621610 300 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 uc_338.21-201ENST00000622458 147 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC017002.5-201ENST00000630717 871 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 MED23-209ENST00000539158 1636 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC019330.1-201ENST00000637390 1692 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 SLC11A2-202ENST00000262052 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 PTK2B-201ENST00000346049 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 SMARCA2-258ENST00000637103 5657 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 RUBCN-201ENST00000273582 6955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 UNC79-205ENST00000555664 8484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 FBXO48-201ENST00000377957 5666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 SPATA31E3P-201ENST00000613133 4214 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 GCSAML-211ENST00000623578 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 CCT5-201ENST00000280326 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 ADGRE1-204ENST00000381407 2687 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 MFAP5-203ENST00000433590 2308 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 NLRC5-217ENST00000539144 6505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 MCM3AP-202ENST00000397708 6333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC005840.3-201ENST00000541888 1803 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 CNTNAP4-201ENST00000307431 4867 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 CNTNAP4-207ENST00000611870 4867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 NBPF15-203ENST00000577412 4707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 GLRX3P2-201ENST00000405027 1038 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 RNF11P2-201ENST00000427702 440 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AL590682.1-201ENST00000437248 344 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC008799.2-201ENST00000484429 647 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 FAM177A1P1-201ENST00000503598 473 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 NDFIP1P1-201ENST00000543144 525 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 RPGR-202ENST00000339363 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 RASSF5-209ENST00000636182 3427 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 NHLRC3-203ENST00000470258 3298 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 WISP3-202ENST00000361714 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 VIL1-201ENST00000248444 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 EIF4E2-202ENST00000409098 3448 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 CACNA1S-202ENST00000367338 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 SLC24A4-201ENST00000393265 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 CABYR-206ENST00000463087 1792 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 LINC02181-201ENST00000430050 4083 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 RIPOR2-202ENST00000378023 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 MAPK10-316ENST00000641430 2285 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 NPL-203ENST00000367553 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 CHODL-203ENST00000400127 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 CASP12-201ENST00000375726 1306 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 SSX6-201ENST00000376932 562 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 GRXCR1-201ENST00000399770 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 RPL5P4-201ENST00000434805 886 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC006065.2-201ENST00000536978 211 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC233290.1-201ENST00000553021 1186 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC103808.6-201ENST00000578035 464 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 ZNF730-201ENST00000593635 464 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC074135.1-202ENST00000600223 563 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 LCA5-203ENST00000467898 2894 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 HAPLN1-201ENST00000274341 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 TPTE-205ENST00000622113 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 OPHN1-201ENST00000355520 7879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 SORCS1-202ENST00000344440 3009 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 MAPK10-345ENST00000641724 2980 ntAPPRIS P2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC010997.6-201ENST00000623230 1645 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 PKNOX1-203ENST00000432907 5180 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 CCNK-201ENST00000389879 3524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
POLR2AP24928 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms