Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX9Q9Y5X1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms