Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PAXBP1Q9Y5B6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms