Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFG3L2Q9Y4W6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms