Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
R3HCC1Q9Y3T6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms