Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP3Q9Y3E7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP3Q9Y3E7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP3Q9Y3E7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP3Q9Y3E7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP3Q9Y3E7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP3Q9Y3E7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP3Q9Y3E7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP3Q9Y3E7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP3Q9Y3E7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP3Q9Y3E7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP3Q9Y3E7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP3Q9Y3E7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP3Q9Y3E7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP3Q9Y3E7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP3Q9Y3E7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP3Q9Y3E7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP3Q9Y3E7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms