Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF9BQ9UPX0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms