Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1RE1Q9UN81 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms