Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHA12Q9UN75 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms