Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALKQ9UM73 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALKQ9UM73 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms