Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DENND2AQ9ULE3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms