Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms