Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PACSIN3Q9UKS6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PACSIN3Q9UKS6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms