Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTNNA3Q9UI47 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms