Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAI1Q9UI46 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAI1Q9UI46 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms