Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP25Q9UHP3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP25Q9UHP3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms