Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHORDC1Q9UHD1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms