Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA9Q9UGM1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms