Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLKQ9UBT6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLKQ9UBT6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms