Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPG2Q9UBF2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms