Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLKQ9UBE8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLKQ9UBE8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms