Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ORC3Q9UBD5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ORC3Q9UBD5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms