Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFIP11Q9UBB9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms