Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms