Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFNKQ9P0W0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms