Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHMP5Q9NZZ3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP5Q9NZZ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms