Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCLQ9NW38 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCLQ9NW38 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms