Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms