Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms