Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTBP3Q9NS15 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
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