Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL17Q9NRX2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms