Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
DUOX2Q9NRD8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DUOX2Q9NRD8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms