Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB18Q9NP72 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms