Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms