Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC52A2Q9HAB3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms