Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms