Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP44Q9H0E7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP44Q9H0E7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms