Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLIRPQ9GZT3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLIRPQ9GZT3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms