Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM6Q9C030 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM6Q9C030 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms