Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD1Q9BXT4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms