Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRRTQ9BXP5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRRTQ9BXP5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms