Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAIPQ9BWF2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAIPQ9BWF2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAIPQ9BWF2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAIPQ9BWF2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAIPQ9BWF2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAIPQ9BWF2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAIPQ9BWF2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms