Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms